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Reshape希望通过自动化实验室实验的“视觉”部分来帮助“解码自然”

一家丹麦初创公司希望帮助研发团队自动化需要视觉检查的实验室实验,筹集了2000万美元的A轮融资,以在美国扩展其技术。

成立于2018年的Reshape总部位于哥本哈根,该公司开发了一种配备软件和人工智能模型的机器成像系统,帮助科学家跟踪来自培养皿和类似板式格式的视觉变化,如颜色或细胞生长速率。其机器配备内置孵化器,可设定特定温度,并记录相应数据,以确保实验能够轻松重复进行。

其中的好处是这些实验可以在没有直接监督的情况下全天候运行,解放了技术人员用于其他关键任务。

Reshape机器正在工作 图片来源:Reshape

“解码自然”

“解码自然”的概念是Reshape设定要实现的核心目标,延续了一个更广泛的趋势,即自然和人造世界之间的界限变得模糊。硅谷也看到了这些机会,并通过大量投入技术寻求“工程”生物的证明。

Reshape首席执行官Carl-Emil Grøn告诉TechCrunch:“整体上,生物学正在从一门科学过渡为一门工程学科,我认为我们想做的最重要的事情之一就是使一些非常‘抽象的’事情 - 物体如何生长,它的行为是如何的?- 更容易描述。”“理想情况下,我们想弄清楚如何建立现实世界中发生的事情与DNA中发生的事情之间的翻译层。”

Reshape的创立源于Grøn的工程背景,当时他正在与一位从事生物技术行业的人约会,这让他深刻了解到实验室实验中涉及的大量手动工作。

Grøn说:“我以为生物技术已经被大规模自动化了,但是每8个小时,每天,连续五个月,她都不得不进入实验室拍摄一张培养皿的照片。”“当你来自技术世界时,这似乎是疯狂的。”

在哥本哈根地区与许多生物技术公司交谈后,Grøn意识到他最初的经历并不是一种奇怪的异常:实验室进行DNA测序、测量化学成分以及其他操作方式基本上仍在与一个多世纪前相同的方式进行。

因此,Grøn邀请了两位联合创始人Daniel Storgaard和Magnus Madsen,着手构建一个全套平台,配备了高分辨率相机和照明,以捕获视觉数据点和时间跨度,并记录给定实验中不同组分如何对其所受条件作出反应。

底层

Reshape开发自己的人工智能模型,在自己的实验室内部数据上进行训练,这些模型可以立即用于一些更常见的实验类型,如涉及真菌或细菌宿主、种子和昆虫的实验。但是该公司也可以帮助客户为特定用例训练模型,例如跟踪特定微生物在某些条件下的行为。

Grøn说:“Reshape的数据科学团队使用我们自行开发的MLOps架构,处理这一端到端过程,从理解期望的输出和量化、大规模注释所需数据集、开发和基准测试模型,然后将其部署在我们的产品中供客户使用。”

例如,一家农业公司可以使用Reshape测试种子萌发率或特定疾病的严重程度。或者一家食品公司可以执行成分表征以测试质量、新鲜度或成分随时间成熟的方式 - 任何通常需要进行视觉评估的内容。

检测到实验中的生长 图片来源:Reshape

一些Reshape的客户正在使用平台技术从化学制剂转变为生物杀虫剂 - 基本上是找出哪种新化合物效果最好,并记录它们是如何制造的。速度最终是客户的主要吸引力。

Grøn表示:“他们会进行4到10倍的实验,比以前能做的实验更多,这意味着他们可以更快地将产品推向市场。”

Reshape将结果以云端界面的形式提供查看,但该平台还支持以LIMS或CSV等格式导出数据,使用户可以将数据带到其他生物技术软件中,如Benchling甚至仅仅是Excel。

结果通过云端界面呈现。 图片来源:Reshape

在准确性方面,Grøn表示将底层模型与同一实验中的人类表现进行比较,涵盖假阴性等指标。这有助于避免实验可能由于科学家认为实验无效而被提前中止的情况。

Grøn说:“我们帮助减少假阴性约80%。我们还帮助客户减少获得结果所需的时间。而不是依靠记得几年前如何执行实验,我们会完美地跟踪。因此,每次在平台上运行实验时,我们都会跟踪它;可重复性非常重要。”

就业务模式而言,Reshape将整个平台作为订阅销售,其中包括硬件、机器学习和基础软件。定价按“价值为基础”的模式计费,对于每个客户可能有所不同。

目前,Reshape仅提供一种规格的机器,这意味着如果客户有很多实验,他们必须获得很多机器。因此,要将此扩展到大型工业级实验,Reshape可能需要更大的机器;Grøn对此问题保持了一定的谨慎态度,但他暗示他们将来可能会“扩展”到更大的设备。

Reshape的成像机器。 图片来源:Reshape

增长

作为Y Combinator(YC)2021年冬季批次的毕业生,Reshape已经积累了一大批客户,包括瑞士农业技术巨头Syngenta和牛津大学。凭借另一笔2000万美元的资金,这笔资金跟随去年810万美元的种子轮融资,Reshape表示计划利用这笔新资金在美国扩大业务,其中大约三分之二的收入已经来源于其欧洲客户的美国设施,尽管主要是来自欧洲客户的。

“我们已经证明了我们的技术有效 - 现在是扩展并帮助尽可能多的实验室加速生物学过渡的时候了,”Grøn说。

其他公司也在将自动化引入科学实验室,包括伦敦的Automata,该公司去年筹集了4000万美元以针对更广泛的实验室工作流程进行目标定位。一些公司提供类似于Reshape尝试做的事情,如Singer Instruments的PhenoBooth和Interscience的ScanStation。

但是,提供一整套平台,完整的端到端数据管理系统,准备就绪,Grøn认为这是Reshape与众不同的地方。

Grøn表示:“这是一个许多公司长期以来一直在努力解决的昂贵问题。我们在一个封闭循环系统中提供孵化、成像和分析。我们的预训练模型立即可用,不需要耗时的训练。”

Reshape的A轮融资由欧洲风投公司Astanor Ventures领投,YC、R7、ACME、21stBio和Unity的联合创始人Nicholas Francis参与投资。

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